粤港澳大湾区建设如期进入“加速期”之际，中央又将另一个区域发展规划──长三角一体化提升为国家战略，使两大区域竞争的老话题再次引发外界关注。其中，长三角一体化由上海、江苏、浙江、安徽3省1市组成，上海是“龙头大哥”，3省主动接轨。而大湾区以香港、澳门、广州、深圳作为“四核驱动”，让人担心会产生内耗。不过，深圳大学校长李清泉在全国“两会”期间指出，长三角与粤港澳大湾区的合作模式不同，大湾区的优势在于多元化，各方在经济、文化等多面的碰撞下，能带来更多机遇；而长三角的“一元化”可能带来弊端。李清泉分析认为，长三角恰恰是因为确立了单核心，未来发展过程中，很多资源会向龙头聚集，对长三角一体化未必是好事。他相信大湾区只要在统筹和协调上做好，加强科研合作、人流来往，就不怕竞争。在大湾区合作方面，李清泉指出，香港的研究水平很高，但是转化意愿不高，主要是缺乏企业愿意转化，因为香港市场小、成本高，香港人可能会因此觉得“不划算”，香港研究的成果都给广东拿去变现赚钱。目前看来，香港河套区开发是其中一个切实可行的解决方案，可惜发展太慢。李清泉也认为，深圳居民赴港收紧为“一周一行”、税收安排等恐成为大湾区发展的制约因素。
